La biologie moléculaire est une discipline scientifique au croisement de la génétique, de la biochimie et de la physique, dont l’objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire.

Plan du cours Biologie Moléculaire

Partie I : La structure des acides nucléiques

Chapitre 1 : Molécules simples

1.1 Phosphates
1.2 Ribose, désoxyribose
1.3 Purine, Pyrimidine
1.4 Bases puriques
1.5 Bases pyrimidiques
1.6 Nucléosides et nucléotides
1.7 Nomenclature des unités nucléotidiques
1.8 Adénosine
1.9 Désoxyguanosine
1.10 Uridine MonoPhosphate
1.11 Désoxythymidine MonoPhosphate
1.12 Adénosine Tri Phosphate
1.13 Désoxycytidine Tri Phosphate
1.14 Liaisons hydrogène
1.15 Hybridation A – T
1.16 Hybridation G – C

Chapitre 2 : Les acides nucléiques

2.1 Acide ribonucléique
 2.2 Les extrémités 5’ et 3’ d’un acide nucléique
 2.3 Structure secondaire du RNA
 2.4 Acides ribonucléiques
 2.5 Acide désoxyribonucléique
 2.6 La double hélice (modèle rubans)
 2.7 La double hélice (travers)
 2.8 La double hélice (axe)
 2.9 Surenroulement
 2.10 Nucléosome
 2.11 Fibre de chromatine
 2.12 Condensation et hydrolyse des nucléotides
2.13 Complémentarité des bases

Partie II : Biosynthèse des macromolécules

Chapitre 3 : DNA Définitions

3.1 La double hélice
3.2 Séquence d’un gène (apoA-II)
3.3 Gène
3.4 Expression d’un gène

Chapitre 4 : La transcription

4.1 Transcription
4.2 Promoteur
4.3 Brins sens et antisens
4.4 Régulation de l’expression
4.5 Cis et trans régulateurs
4.6 DNA binding proteins
4.7 Interaction Protéine DNA
4.8 Récepteurs nucléaires
4.9 Régulation du jeûne
4.10 Régulation de l’effort
4.11 RNA polymérase II
4.12 Initiation de la transcription
4.13 Liaison TFIID sur le DNA
4.14 Régulation de la RNA polymérase
4.15 Elongation de la transcription
76 4.16 Elongation de la transcription
 4.17 Discontinuité des gènes
4.18 Exon
4.19 Exon 1
4.20 Fin de la transcription
4.21 Modifications du transcrit
4.22 Enzyme coiffante
4.23 Coiffe d’un messager
4.24 Queue polyA
4.25 Le transcrit primaire
4.26 Excision – épissage
4.27 Formation du lasso
4.28 Epissages alternatifs
4.29 Maturation des RNA ribosomiques
4.30 Stabilité du messager
4.31 Messager

Chapitre 5 : La traduction

5.1 Traduction
5.2 Expression d’un gène
5.3 Signifiants
5.4 Codon
5.5 Code génétique
5.6 Code génétique
5.7 Code dégénéré
5.8 Ribosome eucaryote
5.9 Polyribosome
5.10 RNA de transfert (trèfle)
5.11 RNA de transfert (ruban)
5.12 Activation d’un acide aminé
 5.13 Sérine tRNA synthétase
5.14 Cystéine tRNA synthétase
5.15 Initiation de la traduction
5.16 Cadre de lecture
5.17 Elongation de la traduction
5.18 Incorporation d’un acide aminé
5.19 Transfert du peptide
5.20 Translocation des codons
5.21 Liaisons riches en énergie
5.22 Terminaison de la traduction
5.23 Signal-peptide
5.24 Polyribosomes liés
5.25 Carboxylation de l’acide glutamique
 5.26 Modifications post-traductionnelles

Chapitre 6 : La réplication

6.1 Réplication
6.2 Le cycle cellulaire
6.3 Chromatine et ADN
 6.4 Réplication semi-conservative
6.5 Synthèse et hydrolyse du DNA
6.6 DNA polymérase
6.7 DNA polymérase (exonucléase 3’→5’)
6.8 DNA polymérase : fonction d’édition
6.9 Boucle de réplication
6.10 Fourche de réplication
6.11 Topoisomérase I
6.12 Primase
6.13 DNA ligase
6.14 Télomérase

Chapitre 7 : La réparation

7.1 Réparation
7.2 Systèmes de réparation du DNA
7.3 Bases endommagées
7.4 Excision de base
7.5 Mésappariements
7.6 Transmission du mésappariement
7.7 Excision de fragment long
7.8 Modèle Holliday
7.9 Coupure du double brin
7.10 Crossing-over

Partie III : Les événements génétiques

 Chapitre 8 : Substitutions

8.1 Substitution
8.2 Somatique, germinale
8.3 Faux-sens, non-sens
8.4 Polymorphisme Xba I de l’apoB
8.5 Marqueur génétique

Chapitre 9 : Mutations

9.1 Mutation
9.2 Mutation Arg3500→Gln de l’apoB-100

Chapitre 10 : Insertions – délétions

10.1 Délétion
10.2 Décalage du cadre de lecture
10.3 Délétion Phe 508 de CFTR
10.4 Délétion de l’exon 9 de la lipoprotéine-lipase
10.5 Mutation d’un site d’épissage
10.6 Insertion

Chapitre 11 : Transpositions

11.1 Transposition
11.2 Séquence Alu
11.3 Virus
11.4 Cycle d’un rétrovirus

11.5 Duplication de gène
11.6 Pseudogène
11.7 Conversion de gène

Partie IV : L’évolution

Chapitre 12 : Divergence
12.1 Divergence

Chapitre 13 : Familles de gènes
 13.1 Famille de gènes
13.2 Gènes des β-globines
13.3 Famille des β-globines

Partie V : Le DNA au laboratoire

Chapitre 14 : Méthodes d’étude
14.1 Extraction et purification du DNA
14.2 Synthèse d’un cDNA
14.3 Electrophorèse de DNA
14.4 Hae III (enzyme de restriction)
14.5 EcoR I
14.6 Polymorphisme de restriction
 14.7 Polymorphisme Msp I de l’apoA-II
14.8 Cartes de restriction
14.9 Hybridation d’une sonde
14.10 Calcul de la Tm
14.11 Sonde hybridée
 14.12 Sonde spécifique d’allèle (ASO)
14.13 Southern blot
 14.14 PCR
14.15 Didésoxyadénosine triphosphate
14.16 Réaction de séquence
 14.17 Séquençage d’ADN
14.18 Gel de séquence

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Chimie minérale est la science qui décrit des corps simples et des composés de tous les éléments autres que le carbone, ainsi que des molécules très simples contenant un seul atome de carbone (oxydes de carbone, carbonates, cyanures …). Nous parlons de chimie minérale car, à l’origine, les corps étudiés venaient du règne minéral. On l’appelle parfois chimie inorganique, par opposition à la chimie organique qui se limite aux composés carbonés présents en abondance dans les règnes végétal et animal.

La chimie minérale des corps simples distingue 3 grandes classes d’éléments : les métaux, les non-métaux et les gaz rares.

Plan du cours Chimie Minérale

Chapitre I: Etat solide cristallin

I-1- Classification des solides cristallins

I-2- Propriétés physiques

I-3- Nature des cristaux et classification périodique

I-4- Notions de cristallographie

Chapitre II: Cristaux métalliques

II-1- La liaison métallique

II-2- Propriétés physiques des métaux

II-3- Structures métalliques

II-3-1- Assemblages compacts

II-3-2- Structures cubique à faces centrées (CFC) et hexagonale compacte

II-3-3- Assemblage semi compact: Structure cubique centrée (CC)

II-4- Insertion dans les réseaux

II-4-1- Condition d’insertion dans une structure CFC

II-4-2- Condition d’insertion dans une structure HC

Chapitre III: Cristaux ioniques

III-1- La liaison ionique

III-2- Stéréochimie de quelques structures de type MX

III-2-1- Structure type chlorure de césium CsCl

III-2-2- Structure type chlorure de sodium NaCl

III-2-3- Structure type ZnS blende

III-2-4- Structure type NiAs

III-2-5- Structure type ZnS wurtzite

III-3- Stéréochimie de quelques structures de type MX2

III-3-1- Structure type fluorine CaF2 et anti fluorine K2O

III-3-2- Structure type rutile TiO2

III-3-3- Structure type cristobalite SiO2

III-4- Rayons ioniques et structures

III-5- Détermination de l’énergie réticulaire des cristaux ioniques

III-5-1- Détermination par la méthode électrostatique

III-5-2- Détermination par la méthode thermodynamique

Chapitre IV: Cristaux covalents et cristaux moléculaires

IV-1- Les cristaux covalents

IV-1-1- Exemples de structures unidimensionnelles

IV-1-2- Exemple de structure bidimensionnelle : le graphite

IV-1-3- Exemple de structure tridimensionnelle : le diamant

IV-2- Les cristaux moléculaires

IV-2-1- Exemples de cristaux moléculaires à liaisons de Van der Waals

IV-2-2- Exemples de cristaux moléculaires à liaisons hydrogène

IV-3- Les liaisons intermoléculaires dans les cristaux covalents et dans les cristaux moléculaires

IV-3-1- Les liaisons de Van der Waals

IV-3-2- La liaison hydrogène

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